Für Magnetbases gibt es Metallkisten im Baumarkt (flache, blaue für Schrauben und höhere graue oder blaue für Bohrmaschinen). Die hohen gibt es für etwa 12,- Euro. Ich wüßte nicht, was geeigneter ist.
Wer übrigens nicht transportieren, sondern aufbewahren will. Die Empfehlung: HELMER von IKEA (Metall-Roll-Container). In den Metallschubladen stehen die Magnetbasen super. Für das Spiel kann man die Schubladen einfach rausnehmen und zum Tisch gehen.
Aufbewahrung und Transport ist bei den meisten Systemen eine Belastung für die Figuren. Nicht bei diesem System, die Figuren stehen frei, sie kommen mit nichts in Berührung. Abnutzung gibt es nur beim Spiel (und die lässt sich nicht verhindern).